Københavns Museums kerneopgave er at indsamle, formidle og forske i alle perioder af Københavns historie. Museet stræber efter at være et museum for dialogen om Københavns fortid, nutid og storbyens fremtidige udvikling ved – gennem viden om og formidling af hovedstadens kulturarv – at forholde sig til aktuelle problemstillinger og sætte dem i historisk og materielt perspektiv via museets samlinger.